在撰写硕士论文时，参考文献的整理是至关重要的一环。首先，建议及时记录文献信息，包括作者、题目、出版时间等，以便后续引用。其次，要选择权威可靠的文献来源，如学术期刊、权威网站等，确保文献质量。此外，要注意标注文献的引用格式，如APA、MLA等，确保格式统一规范。最后，在整理文献时，可以借助文献管理工具，如EndNote、NoteExpress等，提高整理效率。

另外，在整理参考文献时，要注意避免抄袭问题，确保引用内容符合学术规范。可以通过查重软件进行自查，排查可能存在的抄袭风险。同时，要定期更新文献信息，保持文献库的及时性和完整性。总的来说，整理参考文献需要细心、耐心和严谨，只有做好这些工作，才能为硕士论文的撰写奠定良好的基础。